MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011835	CG	4	8	254	261	0 %	0 %	50 %	50 %	219682500
2	NC_011835	GGCT	2	8	267	274	0 %	25 %	50 %	25 %	219682500
3	NC_011835	GGT	2	6	296	301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682500
4	NC_011835	CAC	2	6	305	310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682500
5	NC_011835	GC	3	6	382	387	0 %	0 %	50 %	50 %	219682500
6	NC_011835	GCC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682500
7	NC_011835	GGA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682500
8	NC_011835	GCC	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682500
9	NC_011835	GCG	3	9	594	602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682500
10	NC_011835	CGA	2	6	641	646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
11	NC_011835	GCA	2	6	689	694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
12	NC_011835	ACG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
13	NC_011835	CAC	2	6	782	787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682500
14	NC_011835	CGC	2	6	802	807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682500
15	NC_011835	GTTC	2	8	823	830	0 %	50 %	25 %	25 %	219682500
16	NC_011835	CGG	2	6	992	997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682500
17	NC_011835	CG	3	6	1069	1074	0 %	0 %	50 %	50 %	219682500
18	NC_011835	CGAG	2	8	1087	1094	25 %	0 %	50 %	25 %	219682500
19	NC_011835	ACGA	2	8	1101	1108	50 %	0 %	25 %	25 %	219682500
20	NC_011835	TGC	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682500
21	NC_011835	CGA	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
22	NC_011835	CGG	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682500
23	NC_011835	TTC	2	6	1251	1256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682500
24	NC_011835	GCC	2	6	1313	1318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682500
25	NC_011835	GGA	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682500
26	NC_011835	GCC	2	6	1388	1393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682500
27	NC_011835	ACG	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
28	NC_011835	CAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219682500
29	NC_011835	CT	3	6	1544	1549	0 %	50 %	0 %	50 %	219682500
30	NC_011835	ACC	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682500
31	NC_011835	CAC	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682500
32	NC_011835	CAT	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682500
33	NC_011835	CG	4	8	1640	1647	0 %	0 %	50 %	50 %	219682500
34	NC_011835	CGA	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
35	NC_011835	GCC	2	6	1693	1698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682500
36	NC_011835	CG	3	6	1741	1746	0 %	0 %	50 %	50 %	219682500
37	NC_011835	CGG	2	6	1787	1792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682500
38	NC_011835	ACCAC	2	10	1798	1807	40 %	0 %	0 %	60 %	219682500
39	NC_011835	CATG	2	8	1811	1818	25 %	25 %	25 %	25 %	219682500
40	NC_011835	AGC	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682500
41	NC_011835	AGC	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011835	T	6	6	1996	2001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011835	GGC	3	9	2013	2021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011835	CGG	2	6	2030	2035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011835	GAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011835	TG	3	6	2158	2163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011835	CGC	2	6	2167	2172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011835	CGG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011835	TGT	2	6	2257	2262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011835	CA	3	6	2282	2287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011835	TAC	2	6	2353	2358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011835	TCG	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011835	TCA	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011835	CGG	2	6	2398	2403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011835	TTCG	2	8	2543	2550	0 %	50 %	25 %	25 %	219682501
56	NC_011835	GAC	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682501
57	NC_011835	ACGC	2	8	2584	2591	25 %	0 %	25 %	50 %	219682501
58	NC_011835	GGC	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682501
59	NC_011835	CG	4	8	2675	2682	0 %	0 %	50 %	50 %	219682501
60	NC_011835	CGT	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682501
61	NC_011835	GCT	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682501
62	NC_011835	TGC	2	6	2758	2763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682501
63	NC_011835	GAC	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682501
64	NC_011835	CCGGC	2	10	2815	2824	0 %	0 %	40 %	60 %	219682501
65	NC_011835	CGA	2	6	3068	3073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682501
66	NC_011835	GCG	2	6	3090	3095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682501
67	NC_011835	CCGTT	2	10	3128	3137	0 %	40 %	20 %	40 %	219682501
68	NC_011835	CCG	2	6	3247	3252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682501
69	NC_011835	TGG	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682501
70	NC_011835	AACGC	2	10	3346	3355	40 %	0 %	20 %	40 %	219682501
71	NC_011835	CGGC	2	8	3397	3404	0 %	0 %	50 %	50 %	219682501
72	NC_011835	GAC	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682501
73	NC_011835	GCA	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682501
74	NC_011835	GAG	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682501
75	NC_011835	GCA	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011835	AGGA	2	8	3676	3683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011835	TCG	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682502
78	NC_011835	TCG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682502
79	NC_011835	GCC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682502
80	NC_011835	CG	3	6	3903	3908	0 %	0 %	50 %	50 %	219682502
81	NC_011835	AGA	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682502
82	NC_011835	ACA	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219682502
83	NC_011835	GAC	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682502
84	NC_011835	CGG	2	6	4022	4027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682502
85	NC_011835	TCG	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682502
86	NC_011835	CGA	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682502
87	NC_011835	CGTT	2	8	4125	4132	0 %	50 %	25 %	25 %	219682502
88	NC_011835	GCC	2	6	4143	4148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682502
89	NC_011835	CG	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	219682502
90	NC_011835	AGG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682502
91	NC_011835	GAG	2	6	4260	4265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682502
92	NC_011835	GC	3	6	4266	4271	0 %	0 %	50 %	50 %	219682502
93	NC_011835	CGT	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682502
94	NC_011835	CGA	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682502
95	NC_011835	GGC	2	6	4508	4513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682502
96	NC_011835	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682502
97	NC_011835	TCG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682502
98	NC_011835	CGCTGG	2	12	4654	4665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219682502
99	NC_011835	TCT	2	6	4688	4693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682502
100	NC_011835	GTG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682502
101	NC_011835	CGA	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682502
102	NC_011835	CGT	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682502
103	NC_011835	ATC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682502
104	NC_011835	GCG	2	6	4818	4823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682502
105	NC_011835	GCCCAT	2	12	4854	4865	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219682502
106	NC_011835	GGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682502
107	NC_011835	GGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682502
108	NC_011835	GCCG	2	8	4937	4944	0 %	0 %	50 %	50 %	219682502
109	NC_011835	GCC	2	6	4968	4973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682502
110	NC_011835	GCAT	2	8	4999	5006	25 %	25 %	25 %	25 %	219682502
111	NC_011835	GCAG	2	8	5007	5014	25 %	0 %	50 %	25 %	219682502
112	NC_011835	GAGC	2	8	5116	5123	25 %	0 %	50 %	25 %	219682502
113	NC_011835	GCCG	2	8	5164	5171	0 %	0 %	50 %	50 %	219682503
114	NC_011835	GAG	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682503
115	NC_011835	CGA	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682503
116	NC_011835	GTT	2	6	5287	5292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219682503
117	NC_011835	CGCA	2	8	5383	5390	25 %	0 %	25 %	50 %	219682503
118	NC_011835	TGGG	2	8	5396	5403	0 %	25 %	75 %	0 %	219682503
119	NC_011835	CGT	2	6	5445	5450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682503
120	NC_011835	TGC	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682503
121	NC_011835	GCAA	2	8	5574	5581	50 %	0 %	25 %	25 %	219682503
122	NC_011835	GCG	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011835	GC	3	6	5666	5671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011835	C	6	6	5685	5690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_011835	TAG	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011835	TG	3	6	5765	5770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011835	CAAC	2	8	5817	5824	50 %	0 %	0 %	50 %	219682504
128	NC_011835	CGATC	2	10	5861	5870	20 %	20 %	20 %	40 %	219682504
129	NC_011835	ACG	2	6	5905	5910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
130	NC_011835	GAC	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
131	NC_011835	ACG	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
132	NC_011835	CAC	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682504
133	NC_011835	TCG	2	6	6055	6060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682504
134	NC_011835	CGA	2	6	6143	6148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
135	NC_011835	CGA	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
136	NC_011835	CGG	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682504
137	NC_011835	CGG	4	12	6239	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682504
138	NC_011835	CGG	2	6	6263	6268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682504
139	NC_011835	GGT	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682504
140	NC_011835	CG	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	219682504
141	NC_011835	CTA	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682504
142	NC_011835	CGA	3	9	6410	6418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
143	NC_011835	GAC	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
144	NC_011835	GCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
145	NC_011835	CAG	2	6	6507	6512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
146	NC_011835	CGA	2	6	6566	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
147	NC_011835	GC	3	6	6573	6578	0 %	0 %	50 %	50 %	219682504
148	NC_011835	CGGCGA	2	12	6590	6601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219682504
149	NC_011835	GGA	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682504
150	NC_011835	CCA	2	6	6823	6828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682504
151	NC_011835	GGC	2	6	6834	6839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682504
152	NC_011835	GAG	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682504
153	NC_011835	CG	3	6	6858	6863	0 %	0 %	50 %	50 %	219682504
154	NC_011835	CAAAGA	2	12	6911	6922	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	219682504
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158	NC_011835	GAA	2	6	7106	7111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682504
159	NC_011835	CAT	2	6	7112	7117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682504
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161	NC_011835	GAA	2	6	7157	7162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682504
162	NC_011835	CGC	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682504
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164	NC_011835	CGAG	2	8	7246	7253	25 %	0 %	50 %	25 %	219682504
165	NC_011835	GGC	2	6	7287	7292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682504
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167	NC_011835	CGG	3	9	7424	7432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682504
168	NC_011835	ATC	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682504
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170	NC_011835	CGGC	2	8	7567	7574	0 %	0 %	50 %	50 %	219682504
171	NC_011835	GCC	2	6	7592	7597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682504
172	NC_011835	AAGGC	2	10	7675	7684	40 %	0 %	40 %	20 %	219682504
173	NC_011835	ACC	2	6	7767	7772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682504
174	NC_011835	ACC	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682504
175	NC_011835	CGA	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
176	NC_011835	CGA	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682504
177	NC_011835	CCG	2	6	7871	7876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682504
178	NC_011835	CA	3	6	7897	7902	50 %	0 %	0 %	50 %	219682504
179	NC_011835	GCC	2	6	7931	7936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_011835	GT	3	6	7956	7961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011835	AACC	2	8	8004	8011	50 %	0 %	0 %	50 %	219682505
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186	NC_011835	TGG	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682505
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188	NC_011835	GAGC	2	8	8210	8217	25 %	0 %	50 %	25 %	219682505
189	NC_011835	CCG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682505
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191	NC_011835	ACA	2	6	8307	8312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219682505
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250	NC_011835	GCC	2	6	10194	10199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682505
251	NC_011835	CCG	2	6	10203	10208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682505
252	NC_011835	CG	3	6	10229	10234	0 %	0 %	50 %	50 %	219682505
253	NC_011835	CGA	2	6	10237	10242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682505
254	NC_011835	GATG	2	8	10252	10259	25 %	25 %	50 %	0 %	219682505
255	NC_011835	TCG	2	6	10290	10295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682505
256	NC_011835	CGA	2	6	10387	10392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682505
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258	NC_011835	GTC	2	6	10415	10420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682505
259	NC_011835	CAC	2	6	10507	10512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682505
260	NC_011835	CGA	2	6	10546	10551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682505
261	NC_011835	ATC	2	6	10553	10558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682505
262	NC_011835	CGT	2	6	10606	10611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682505
263	NC_011835	GAT	2	6	10696	10701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682505
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265	NC_011835	GAG	2	6	11011	11016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682506
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